Mikrobiyoloji Laboratuvarları

Laboratuvarımızın Bakteriyoloji biriminde klinik örneklerden mikroskobik inceleme, bakteriyolojik kültür ve antibiyotik duyarlılık testleri yapılmaktadır. Çeşitli klinik örneklerden (balgam, idrar, dışkı, kan, vb.) izole edilen patojen bakteriler konvansiyonel yöntemlere ek olarak son teknoloji MALDI-TOF MS (Matrix-assisted laser desorption-ionization time-of-flight mass spectrometry) yöntemi ile tanımlanmaktadır. İzole edilen patojen bakterilere karşı uluslararası standartlara uygun olarak antimikrobiyal duyarlılık testleri yapılmaktadır. Bu amaçla hem disk difüzyon ve E-test yöntemleri gibi geleneksel yöntemler kullanılmakta, hem de otomatize bakteri tanımlama sistemleri ile minimum inhibitör konsantrasyon (MİK) düzeyinde antimikrobiyal duyarlılık belirlenmektedir. Kan, kemik iliği ve kateter kültürleri otomatize kültür sistemleri ile değerlendirilip, patojen bakteri tespiti durumunda yukarıda bahsedilen tanımlama ve antibiyotik duyarlılık işlemleri yapılmaktadır.

Laboratuvarımızın Seroloji Biriminde, enfeksiyon etkeni olan mikroorganizmalara (bakteri, virüs, mantar, parazit) veya vücudun kendi proteinlerine (oto-immün hastalıklar) karşı gelişen antikorların veya özgül mikroorganizma antijenlerinin varlığı araştırılmaktadır. Laboratuvarımızda hepatit, HIV (AIDS) başta olmak üzere enfeksiyon hastalıklarının ve romatizmal hastalıkların tanısına yönelik çok geniş bir yelpazede test uygulanmaktadır. Bu hastalıkların tanısı için hastadan alınan kan, idrar, beyin omurilik sıvısı gibi klinik örneklerde ilgili antijen veya antikorlar son teknoloji kullanılarak araştırılmakta ve uluslararası tanı standartlarına göre raporlanmaktadır.

Mikoloji Birimimizde, mantar enfeksiyonlarının laboratuvar tanısına ve mantar izolatlarının antifungal ilaçlara duyarlılıklarının saptanmasına yönelik testler yürütülmektedir. Bu amaçla, tanı için, günümüzde bu enfeksiyonların tanısında altın standart olarak kabul edilen direk mikroskobik inceleme ve kültür yöntemleri kullanılmakta, klinik örneklerden üretilen mantarlar, klasik yöntemlerle tür düzeyinde tanımlanmaktadır. Tedavide hangi ilaçların kullanılmasının uygun olduğunun saptanmasında yol gösterici olan antifungal duyarlılık testleri de, uluslararası komitelerce geliştirilmiş olan ve kullanılması önerilen referans yöntemlerle gerçekleştirilmektedir. Mikoloji Birimimizde ayrıca, Cryptococcus kapsül antijen testi, bu mantara bağlı gelişen enfeksiyonların tanısı için, direk mikroskobik inceleme ve kültüre eşlik edecek şekilde uygulanmaktadır.

Parazitoloji Birimimizde, paraziter enfeksiyonların laboratuvar tanısına yönelik testler yürütülmektedir. Bu amaçla protozoa ve helmintlerin tanısında direkt mikroskobik inceleme, kalıcı boya yöntemleri ve bazı protozoalar için kültür yöntemleri uygulanmaktadır. Laboratuvara gelen dışkı örnekleri yarı otomatize sistemle mikroskobik olarak değerlendirilmekte ve trikrom, MAF gibi boyalar yardımıyla tür düzeyinde tanı yapılabilmektedir. Dışkının yanı sıra kan, balgam, bronkoalveoler lavaj (BAL), kist sıvısı gibi örnekler de çalışılarak tanı konulmakta, tanıda floresan mikroskoptan da yararlanılmaktadır.

Moleküler Mikrobiyoloji Birimimizde, hastalık etkeni mikroorganizmaların klinik örneklerde DNA ve RNA düzeyinde saptanmalarını sağlayacak testler uygulanmaktadır. Bu amaçla otomatize sistemlerle nükleik asit izolasyonu sonrasında PCR, real-time PCR, strip hibridizasyon ve DNA dizi analizi gibi testler en güncel ve güvenilir yöntemlerle yapılmaktadır. Bu yöntemler sadece tanı amacıyla değil, tedavinin takibinde de kullanılmaktadır. Moleküler yöntemlerle özellikle HBV, HCV, HIV ve CMV gibi önemli mikroorganizmaların klinik örneklerdeki miktarları kantitatif olarak da belirlenebilmekte ve belirli aralıklarla ölçülen virus miktarlarındaki azalma veya artışlar, uygulanan tedavinin etkinliğini göstermek açısından klinisyenlere yol gösterici olmaktadır. Moleküler Mikrobiyoloji Birimimizde farklı klinik örneklerde otuzdan fazla mikroorganizma saptanabilmektedir.